En tant que gardiennes magiques de notre monde, les W.I.T.C.H. ont atteint des millions de spectateurs avec leur série télévisée et leur bande dessinée au début des années 2000. Anciens et nouveaux fans découvrent ici comment tout a commencé : au cœur de l'infini, dans la forteresse de Kandrakar, réside l'Oracle : le pouvoir qui maintient l'équilibre dans l'univers. Pour cela, il nomme des gardiens qui protègent le grand réseau séparant le monde des humains des autres dimensions. Cependant, le réseau s'affaiblit et de plus en plus de portails s'ouvrent vers notre réalité.

Dotées de la puissance des quatre éléments, les nouvelles gardiennes Will, Irma, Taranee, Cornelia et Hay-Lin font face à la grande menace qui pèse sur leur monde : le prince Phobos, qui occupe illégalement le trône de Méridian, cherche à conquérir leur dimension. De plus, il a attiré l'héritière légitime du trône et amie des W.I.T.C.H., Elyon, vers Méridian. Les filles doivent lui faire face – tout en gérant en même temps le quotidien normal d'adolescentes avec tous ses problèmes.